• SPRIworks
  • SPRIworks - Fragment Library System I
    Vollautomatische Erstellung von DNA-Bibliotheken für Next-Gen Sequenzer (Version I für Illumina Genome Analyzer)

    Das von Beckman Coulter entwickelte SPRIworks Fragment Library System I zur vollautomatischen Erstellung von Fragment- bzw. Genbibliotheken nutzt die SPRI-Technologie (Solid Phase Reversible Immobilization), ein auf der Anwendung paramagnetischer Beads basierendes Verfahren zur Nukleinsäure-Aufreinigung. Durch Eliminierung der Säulenreinigungsschritte und der Größenselektion mittels Gelelektrophorese, wurden die Voraussetzungen für die vollautomatische Erstellung von DNA-Bibliotheken geschaffen.
    So erstellt das SPRIworks in unter 5 Stunden vollautomatisch bis zu 10 DNA-Bibliotheken (DNA libraries) mit einer minimalen Vorbereitungszeit von nur 10 Minuten.
    Diese Erstellung erfolgt im SPRI-TE-Gerät (plus Methodenkarte) mit nur einer Kartusche pro DNA-Bibliothek, die den gesamten Prozess beginnend mit fragmentierter DNA, allen notwendigen enzymatischen Reaktionen, entsprechenden Aufreinigungen und der variablen Größenselektion bis hin zum für die PCR fertigen Probe abbildet.
    Dies ermöglicht eine Durchsatzerhöhung einhergehend mit einer deutlichen Reduktion manueller Schritte and einer konsistenten Qualität der Bibliotheken.

Spezifikationen

  • kompletter Library-Konstruktionsprozess in einer Reagenzien-Kartusche
  • bis zu 10 Library-Präparationen parallel
  • 10 „PCR-ready“ Bibliotheken in 3-5 Stunden (je nach Protokoll)
  • inklusive aller notwendigen DNA-Aufreinigungschritte
  • inklusive Grössenselektions-Modus (200-400bp, 300-600bp, ohne)

durch die Möglichkeit der automatischen Grössenselektion für die Leselänge fällt der zeitaufwändige Schritt der Größenselektion über die Gelelektrophorese ersatzlos weg.

 

Fragment-Library Erstellung

  • 1. Einstecken der Methodenkarte für das jeweilige Sequencer-System in das Gerät
  • 2. Einsetzen der Reagenzien-Kartusche(n) ins Rack 1
  • 3. Einsetzen der Plastikware incl. Proben DNA und Adapter ins Rack 2
  • 4. Auf START drücken
  • 5. Fertig