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Automatisierte Probenvorbereitung für NextGen Sequencing
Beckman Coulter bietet für Anwender von NextGen-Sequencing-Technologien eine Vielzahl unterschiedlicher technischer Lösungen im Bereich der Probenvorbereitung.
Mit dem SPRIworks-System stehen dem Anwender validierte Methoden für die Library Preparation für Illumina GAII und HiSeq, Roche/454 GSflex und Junior, sowie Life Technologies/ABI SOLiD zur Verfügung. Für Anwender mit hohen Durchsätzen in der Library Preparation stehen zusätzlich auf Biomek-Liquid Handling-Systemen basierende Lösungen zur Verfügung, die zudem eine höhere Flexibilität bereitstellen.
Daneben können weitere arbeitsintensive Schritte des Workflows automatisiert werden, beispielsweise durch Integration eines Roche REMe für die Emulsion-PCR bei Roche/454-Anwendungen. Für Anwender im Bereich des Amplicon Sequencing kann die Biomek-Plattform außerdem das Ansetzen und Aufreinigen von PCR-Reaktionen übernehmen.Die derzeit verfügbaren Methoden finden Sie unter Broschüren / Datenblätter in der PDF-Datei: verfügbare Methoden - Our Solutions for Next Generation Sequencing.
Vorteile unserer Automation
- Verbesserte Robustheit und Reproduzierbarkeit ihrer DNA/RNA-Ausbeute im Vergleich zu manuellem Arbeiten
- Eindeutige Zuordnung und präzises Sample Tracking ihrer Proben durch integrierte Datenbanken
- Steigerung ihres Durchsatzes durch verbesserte Pipettiereffizienz
Qualitätskontrolle der Libraries an einer Pilotstudie für den GS Flex 454/Roche. Die durchschnittliche Recovery der Libraries war in den automatisierten Protokollen etwas besser als im manuellen Prozess (Abb. 4A und 4B) während die Größenverteilung der automatisierten Proben etwas aufgeweitet ist (Abb. 4C).
